شبکه تحقیقات پزشکی مولکولی وزارت بهداشت (صادر کننده گواهی های رسمی، آموزشی معتبر در کشور) در نظر دارد از تاریخ 19لغایت21 اردیبهشت ماه 94 کارگاه تئوری و عملی " تحلیل داده های امیک در نرم افزار R " را برگزار نماید.
مقدمه و معرفی کاربردهای کارگاه :
همزمان با پیشرفت روز افزون روش های اندازه گیری ترکیبات زیستی، رویکردی نوین تحت عنوان رویکرد امیک در زیست شناسی توسعه یافته است. بسته به نوع ترکیب زیستی انواع فناوری های امیک معرفی شده اند. به عنوان مثال می توان به ژنومیک، پروتئومیک، متابولومیک و ترانسکریپتومیک اشاره کرد که هر یک به ترتیب به بررسی و مطالعه پربازده یا هایتروپوت ژنها، پروتئین ها، متابولیت ها و رونوشت های mRNA می پردازند. نوع داده های خام تولید شده توسط این روش ها از نوع پربازده بوده و تحلیل و بررسی آنها نیازمند امکانات سخت افزاری و نرم افزاری ویژه ای است. نرم افزار R یکی از قدرتمندترین نرم افزارها در راستای تحلیل چنین داده هایی است. در این کارگاه سعی داریم ضمن معرفی ساختار داده های مختلف امیک و کلیت نرم افزار R بتوانیم در راستای تحلیل این داده ها در این نرم افزار آموزش های کاربردی و موردنیاز جامعه علمی کشور ارائه گردد.
اهداف کلی:
تحلیل داده های امیک به کمک نرم افزار R
اهداف اختصاصی:
آشنایی با ساختار داده های مختلف امیک
تحلیل داده های ژنومیک به کمک نرم افزار R
تحلیل داده های پروتئومیک به کمک نرم افزار R
تحلیل داده های ترانسکریپتومیک به کمک نرم افزار R
تحلیل داده های هستی شناسی ژنی به کمک نرم افزار R
گروه مخاطبین (گروه هدف):
_ اعضای هیات علمی دانشگاهها و مؤسسات پژوهشی کشور در رشته های مختلف علوم زیستی و پزشکی
_ دانشجویان تحصیلات تکمیلی در رشته های مختلف علوم زیستی و پزشکی
_ علاقه مندان به مباحث نوین زیست شناسی
مدرسین این دوره:
_ دکتر محی الدین جعفری ( عضو هیات علمی انستیتو پاستور ایران)
_ دکتر بهروز وزیری ( عضو هیات علمی انستیتو پاستور ایران)
_ دکتر سروش سرداری ( عضو هیات علمی انستیتو پاستور ایران و رییس واحد بیوانفورماتیک و طراحی دارو)
_ دکتر مهدی میرزایی ( دانشگاه تربیت مدرس)
_ دکتر سید ابوالفضل مطهری ( دانشگاه صنعتی شریف)
_ دکتر ناصر انصاری پور ( دانشگاه تهران)
زمان:
19 الی 21 اردیبهشت ماه 94
محل اجرا:
انستیتو پاستور ایران
تلفن ثبت نام:
66954324ـ021
64112449ـ021
molmednet@gmail.com
molmednet@yahoo.com
برنامه کامل 3 روزه کارگاه:
روز اول:
_ مروری بر مفاهیم آماری
_ چالش های آماری داده های امیک
_ آشنایی با نرم افزار R و( RStudio(1
_ آشنایی با نرم افزار R و( RStudio(2
روز دوم:
_ آشنایی با مفاهیم و ساختار داده های ژنومیک
_ آشنایی با مفاهیم و ساختار داده های ترانسکریپتومیک
_ تحلیل داده های ژنوم با نرم افزار R
_ تحلیل داده های ترانسکریپتوم با نرم افزار R
روز سوم:
_ آشنایی با مفاهیم و ساختار داده های پروتئومیک
_ تحلیل داده های پروتئوم با نرم افزار R
_ هستی شناسی ژنی
_ تحلیل غنی سازی ژنی با نرم افزار R
